[Baekjoon]1969번 DNA - Javascript

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1969번: DNA

문제

DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다. 이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine). 우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때, 이 DNA를 이루는 뉴클레오티드의 첫글자를 따서 표현한다. 만약에 Thymine-Adenine-Adenine-Cytosine-Thymine-Guanine-Cytosine-Cytosine-Guanine-Adenine-Thymine로 이루어진 DNA가 있다고 하면, “TAACTGCCGAT”로 표현할 수 있다. 그리고 Hamming Distance란 길이가 같은 두 DNA가 있을 때, 각 위치의 뉴클오티드 문자가 다른 것의 개수이다. 만약에 “AGCAT"와 ”GGAAT"는 첫 번째 글자와 세 번째 글자가 다르므로 Hamming Distance는 2이다.

우리가 할 일은 다음과 같다. N개의 길이 M인 DNA s1, s2, ..., sn가 주어져 있을 때 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA s를 구하는 것이다. 즉, s와 s1의 Hamming Distance + s와 s2의 Hamming Distance + s와 s3의 Hamming Distance ... 의 합이 최소가 된다는 의미이다.

입력

첫 줄에 DNA의 수 N과 문자열의 길이 M이 주어진다. 그리고 둘째 줄부터 N+1번째 줄까지 N개의 DNA가 주어진다. N은 1,000보다 작거나 같은 자연수이고, M은 50보다 작거나 같은 자연수이다.

출력

첫째 줄에 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA 를 출력하고, 둘째 줄에는 그 Hamming Distance의 합을 출력하시오. 그러한 DNA가 여러 개 있을 때에는 사전순으로 가장 앞서는 것을 출력한다.

예제 입력 1 복사

5 8
TATGATAC
TAAGCTAC
AAAGATCC
TGAGATAC
TAAGATGT

예제 출력 1 복사

TAAGATAC
7

예제 입력 2 복사

4 10
ACGTACGTAC
CCGTACGTAG
GCGTACGTAT
TCGTACGTAA

예제 출력 2 복사

ACGTACGTAA
6

 

문제풀이(1)

Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA는 각 자리수별 가장 많이 등장한 DNA며,
Hamming Distance의 합은 가장 작은 DNA를 나열한 것에서 각 자리수마다 다른 것을 더한 값이다.
1. 각 자리수별 가장 많이 등장한 DNA를 찾는다.
2. 각 자리수별 Hamming Distance의 합을 구한다.

const filePath = process.platform === "linux" ? "/dev/stdin" : "./input.txt";
const input = require("fs").readFileSync(filePath).toString().trim().split("\n");

const [N, M] = input.shift().split(" ").map(Number);

let hammingDistanceDNA = "";
let countHammingDistanceDNA = 0;

for (let i = 0; i < M; i++) {
  const map = new Map();
  for (let j = 0; j < N; j++) {
    const dna = input[j][i];
    map.has(dna) ? map.set(dna, map.get(dna) + 1) : map.set(dna, 1);
  }
  const hamming = [...map].sort().reduce((a, b) => (a[1] >= b[1] ? a : b));
  hammingDistanceDNA += hamming[0];
  countHammingDistanceDNA += N - hamming[1];
}

console.log(hammingDistanceDNA);
console.log(countHammingDistanceDNA);